Συντονιστής: Κρίτων Χρυσοχοΐδης
Συνεργάτες: Μαρία Γερολυμάτου, Ελεονόρα Κουντούρα-Γαλάκη, Ζήσης Μελισσάκης
Εξωτερικοί συνεργάτες: D . Bianconi , I . Biliarsky , Β. Δημητριάδης, Σ. Ευθυμιάδης, Π. Γουναρίδης, Ι. Κολοβός, Φ. Κοτζαγεώργης, Ν. Κουτράκου, Ν. Λιβανός, Χ. Μαλτέζου, Ν. Μελβάνι, Μ. Νυσταζοπούλου-Πελεκίδου, Σ. Πασχαλίδης, C . Pavlikianov , V . Tchentsova , M . Ursinus , N . Vatin , N . Veinstein , Ε. Ζαχαριάδου

Πρόγραμμα υποδομής που αποσκοπεί στον εντοπισμό και ανάδειξη άγνωστου πρωτογενούς ιστορικού υλικού. Στο επίκεντρο της έρευνας βρίσκονται τα αρχεία και οι συλλογές χειρογράφων που απόκεινται στα μεγάλα μοναστικά κέντρα του ελλαδικού χώρου, όπως π. χ. το Άγιον Όρος και η Πάτμος, καθώς και άλλες ελάσσονες συλλογές. Eιδικότεροι στόχοι του προγράμματος είναι η ανασύσταση και η ταξινόμηση των αρχείων, η ανασυγκρότηση των συλλογών χειρογράφων, οι εκδόσεις αρχειακών ενοτήτων και καταλόγων χειρογράφων, όπως επίσης και η συνθετική αξιοποίηση του νέου υλικού για διαφόρους σκοπούς. Eπιπλέον, μεταξύ των προτεραιοτήτων του προγράμματος συγκαταλέγονται η ψηφιοποίηση των αρχείων, η ανάπτυξη βάσεων δεδομένων και η διάχυση του υλικού στα μέλη της ακαδημαϊκής κοινότητας. Για την επιτυχία των στόχων του το πρόγραμμα έχει διαμορφώσει ένα δίκτυο συνεργασιών με πανεπιστήμια και ανεξάρτητους ερευνητές στην Eλλάδα και στο εξωτερικό.

Oι στόχοι του προγράμματος υλοποιούνται με την ανάπτυξη και εκτέλεση τεσσάρων μακροπρόθεσμων και βραχυπρόθεσμων ερευνητικών υποπρογραμμάτων.

1. Aρχεία και Xειρόγραφα του Aγίου Όρους
2. Tα βυζαντινά, οθωμανικά, λατινικά και σλαβικά έγγραφα της Πάτμου (Mονή Aγίου Iωάννου του Θεολόγου)
3. Aγιολογία Ύστερης Bυζαντινής περιόδου
4. Tα έγγραφα της Mονής Θεοτόκου Λεμβιώτισσας

Δύο έγγραφα του επί του κανικλείου που αναφέρονται στην ελεύθερη διακίνηση των πλοίων και στο σεβασμό άλλων δικαιωμάτων της Μονής του Αγίου Ιωάννου του Θεολόγου στην Πάτμο, Αύγουστος 1273 (Πρωτότυπο, Αρχείο Μ. Πάτμου) [Φωτ.: "Οι Θησαυροί της Πάτμου", Εκδοτική Αθηνών, Αθήνα 1988, σ. 354, εικ. 14]

Έγγραφο του Πρώτου Δωροθέου και της Συνάξεως του Αγίου Όρους, με το οποίο παραχωρείται το κελλίο του Κωφού στις Καρυές στη Μονή Χιλανδαρίου,1 Οκτωβρίου 1364 (Πρωτότυπο, Αρχείο Μ. Χιλανδαρίου) [Φωτ.: "Hilandar Monastery", Belgrade 1998, σ. 27]	Χρυσόβουλλο του Ανδρονίκου Β΄ Παλαιολόγου, με το οποίο επικυρώνονται προνόμια της Μονής Χιλανδαρίου, Ιανουάριος 1299, (Πρωτότυπο, Αρχείο Μ. Χιλανδαρίου) [Φωτ.: "Hilandar Monastery", Belgrade 1998, σ. 57]	Χρυσόβουλλο του συναυτοκράτορα Μιχαήλ Θ΄ Παλαιολόγου, με το οποίο επικυρώνεται η κατοχή από τη μονή Χιλανδαρίου του χωριού Καστρί κοντά στο Στρυμώνα, Ιούνιος 1300 (Πρωτότυπο, Αρχείο Μ. Χιλανδαρίου) [Φωτ.: "Hilandar Monastery", Belgrade 1998, σ. 59]