Το PATO είναι μια οντολογία φαινοτυπικών ιδιοτήτων με πρωταρχικό σκοπό τον ορισμό σύνθετων φαινοτύπων και φαινοτυπικών ιδιοτήτων. Αυτή η οντολογία μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε συνδυασμό με άλλες οντολογίες όπως την οντολογία γονιδίων (GO) ή τις ανατομικές οντολογίες για να παρέχει φαινοτυπικές περιγραφές. Παραδείγματα ιδιοτήτων είναι το κόκκινο χρώμα, υψηλή θερμοκρασία, μικρό μέγεθος, υπερπλαστικό, κτλ.
Μετρικές μονάδες για τη χρήση σε συνδυασμό με το PATO με πρωταρχικό σκοπό τον ορισμό σύνθετων ποσοτικών φαινοτύπων και φαινοτυπικών ποσοτικών ιδιοτήτων.