CloudScreen

Αντικείμενο του προτεινόμενου έργου αποτελεί η εφαρμογή μιας «one stop shop» υπολογιστικής πλατφόρμας νέας γενιάς για την επανατοποθέτηση και επαναστόχευση φαρμάκων στην ιατρική ακριβείας. Συγκριτικά με τις υπάρχουσες υπολογιστικές προσεγγίσεις, το σύστημα-προϊόν:

(α) δεν περιορίζεται σε 1D δεδομένα (γονιδίωμα-μεταγράφομα-πρωτέομα-μεταβόλομα), αλλά επιμελείται/ενοποιεί/αναλύει/ερμηνεύει 1D και 3D δεδομένα (μοριακού σχεδιασμού και υπολογιστικής χημείας)

(β) ελαχιστοποιεί τα συγχητικά σφάλματα (confounding) στην εξόρυξη/ενοποίηση/ανάλυση δεδομένων και προάγει την αμερόληπτη λήψη αποφάσεων, συγκεράζοντας τις ικανότητες συλλογισμού τεχνητής και ανθρώπινης νοημοσύνης (i) υπηρεσίες εξόρυξης δεδομένων, ii) υπηρεσίες υποστήριξης συνεργασίας και iii) υπηρεσίες υποστήριξης λήψης αποφάσεων)

(γ) παρέχει δυνατότητες δυναμικής επικαιροποίησης και επεκτείνει τις υπηρεσίες κειμένου (πατέντες, ηθικά και νομικά ζητήματα)

(δ) εξυπηρετεί ως «one stop shop» εργαλείο πρόβλεψης και αποτίμησης της αποτελεσματικότητας και τοξικότητας των επαναστοχευμένων μορίων σε νέες ενδείξεις

Επιμέρους στόχοι για το έργο είναι:

(α) η ανάπτυξη «one stop shop» πλατφόρμας νέας γενιάς (CloudScreen) και (β) η επικύρωση του στόχου του έργου μέσω πιλοτικής περίπτωσης φαρμάκου της αγοράς, που αφορά σαφώς καθορισμένα δεδομένα, ώστε να επικυρώσει τη λειτουργία της πλατφόρμας CloudScreen σε διαφορετικές ρυθμίσεις συνεργασίας και λήψης αποφάσεων, που σχετίζονται με ετερογενείς τύπους και πηγές δεδομένων, καλύπτοντας, έτσι, το πλήρες φάσμα των απαιτήσεων μιας εν δυνάμει επανατοποθέτησης προϊόντος. Για το σκοπό αυτό, θα προσδιοριστεί η αποτελεσματικότητα και τοξικότητα της σιταγλιπτίνης, με α) 3D κυτταρικές και ισογονιδιακές σειρές, βάσει μηχανισμού (mechanism-based assays) και για φαινοτυπική σάρωση (phenotypic screening), β) λειτουργικές δοκιμασίες (functional assays), γ) ADME-TOX δοκιμασίες (ηπατικά μικροσώματα ανθρώπου, in vitro προσδιορισμός φαρμακοκινητικού/φαρμακοδυναμικού προφίλ) και φαρμακογονιδιωματικές δοκιμασίες.