OPENSCREEN

Το αντικείμενο του Υποέργου «Οργάνωση και λειτουργία ερευνητικής υποδομής “”OPENSCREEN-GR/ΕΙΕ» αφορά στη δημιουργία ερευνητικής υποδομής στο Ινστιτούτο Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών, στα πλαίσια της έργου «ΟPENSCREEN-GR» με στόχο τη βελτιστοποίηση δομών οδηγών (hit compounds), οι οποίες θα έχουν χαρακτηρισθεί στα πλαίσια των δραστηριοτήτων των άλλων ερευνητικών υποδομών του «ΟPENSCREEN-GR». Θα επιδιωχθεί η διατήρηση και επέκταση της υποδομής μέσω της προσέλκυσης χρηστών εκτός των εταίρων του «ΟPENSCREEN-GR».

Στα πλαίσια της ανακάλυψης και ανάπτυξης νέων φαρμάκων σημαντικό στάδιο αποτελεί η βελτιστοποίση των αρχικά χαρακτηρισμένων βιοδραστικών ενώσεων για ένα συγκεκριμένο στόχο, οι οποίες συνήθως δεν διαθέτουν ούτε την απαιτούμενη ενεργότητα αλλά ούτε και τα δομικά χαρακτηριστικά που να τις καθιστούν κατάλληλες για περαιτέρω ανάπτυξη τους ως πιθανά φάρμακα. Επομένως απαιτείται η σύνθεση βελτιστοποιημένων αναλόγων μέσω συνθετικών τροποποιήσεων των αρχικών δομών. Με αυτό τον τρόπο συντίθενται μικρές σειρές εστιασμένων ενώσεων με στόχο την λήψη σχέσεων δομής-δραστικότητας. Η διαδικασία είναι ανατροφοδοτούμενη και δίνει τη δυνατότητα να επιλεγούν γαι προκλινικό έλεγχο καταλληλότητας μόνο οι ενώσεις με το επιθυμητό βιολογικό προφίλ,  με αποτέλεσμα την εξοικονόμιση πόρων.  Οι τροποποιήσεις των δομών οδηγών (hits) θα καθοδηγηδούν από την in silico αλληλεπίδραση με τον βιολογικό στόχο καθώς επίσης και με υπολογισμό των ADME-Tox ιδιοτήτων μέσω του προγράμματος QiKProp. Με αυτό τον τρόπο θα επιλεγούν αλλαγές των δομικών χαρακτηριστικών, οι οποίες θα στοχεύουν στη αύξηση της δραστικότητας ενώ ταυτόχρονα δεν θα προβλέπεται αρνητική επίδραση σε φυσικοχημικές ιδιότητες όπως διαλυτότητα, πρωτεϊνική δεύσμευση, διαπερατότητα κυτταρικών μεμβρανών, λιποφιλικότητα κ.α. Επίσης θα χρησιμοποιηθεί η στρατηγική της βιοϊσοστερικής αντικατάστασης για τη διαδικασία βελτιστοποίησης (hit to lead optimization, H2L).  Σύγχρονες μέθοδοι οργανικής σύνθεσης, χρήση τεχνικών υψηλής ενέργειας (μικροκύματα, υπέρηχοι) καθώς και παράλληλη σύνθεση θα οδηγήσουν στα νέα ανάλογα. Οι νέες ενώσεις θα απομονωθούν σε καθαρή μορφή με τεχνικές χρωματογραφίας και θα χαρακτηριστούν με φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού μιας και δύο διαστάσεων, IR και φασματομετρία μάζας υψηλής ανάλυσης (HR-MS).