MALDIBANK

Σε μια εποχή που χαρακτηρίζεται από επείγουσες περιβαλλοντικές και υγειονομικές προκλήσεις, όπως η κλιματική αλλαγή, η απώλεια βιοποικιλότητας, οι παγκόσμιες επιδημίες και η επισιτιστική ασφάλεια, η κατανόηση και αξιοποίηση της δύναμης των μικροοργανισμών είναι ζωτικής σημασίας. Οι μικροοργανισμοί, θεμελιώδεις για τη βιόσφαιρα, επηρεάζουν τα πάντα — από τη δυναμική των οικοσυστημάτων έως την ανθρώπινη υγεία. Ωστόσο, η τεράστια ποικιλομορφία τους παραμένει σε μεγάλο βαθμό υποτιμημένη. Για να αξιοποιηθεί αυτό το δυναμικό, είναι κρίσιμη η ακριβής ταυτοποίηση των μικροοργανισμών, ιδιαίτερα δεδομένων των ποικίλων επιπτώσεών τους σε διαφορετικούς τομείς.

Τα τελευταία 15 χρόνια, η φασματομετρία μάζας MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight) έχει φέρει επανάσταση στην ταυτοποίηση μικροοργανισμών σε πεδία όπως η κλινική μικροβιολογία, η ασφάλεια τροφίμων, η περιβαλλοντική παρακολούθηση και η βιώσιμη γεωργία. Παρά τις μεταμορφωτικές της δυνατότητες, η τεχνολογία MALDI-TOF MS έχει υποχρησιμοποιηθεί εκτός του πεδίου της κλινικής μικροβιολογίας.

Το MALDIBANK αναδύεται ως μια πρωτοποριακή πρωτοβουλία για τη διεύρυνση της εφαρμογής αυτής της τεχνολογίας, προσφέροντας καινοτόμες λύσεις για την κατανόηση και αξιοποίηση της μικροβιακής ποικιλομορφίας για την αντιμετώπιση παγκόσμιων προβλημάτων.

Το MALDIBANK έχει σχεδιαστεί ως μια παγκόσμια, βασισμένη στο cloud, ανοικτή βάση δεδομένων φασμάτων MALDI για την ταυτοποίηση μικροοργανισμών, συνδυάζοντας μια εκτενή βάση φασμάτων με προηγμένα αλγοριθμικά εργαλεία. Αυτή η βάση δεδομένων θα διευκολύνει την επεξεργασία, τον χαρακτηρισμό, την επιδημιολογική επιτήρηση και πολλά άλλα, ενσωματώνοντας τις αρχές της Ανοικτής Επιστήμης και των FAIR δεδομένων. Στόχος της είναι να καταστεί ένα νέο σημείο αναφοράς στην ταυτοποίηση μικροοργανισμών, με επίδραση αντίστοιχη του GenBank στον τομέα της γονιδιωματικής.

Με την ενσωμάτωση 100.000 φασμάτων αναφοράς και πλούσιων μεταδεδομένων, καθώς και την αξιοποίηση μοντέλων βαθιάς μάθησης, το MALDIBANK θα ενισχύσει τον χαρακτηρισμό μικροοργανισμών και θα υποστηρίξει τομείς όπως η πρόβλεψη της ανθεκτικότητας στα αντιμικροβιακά και η περιβαλλοντική παρακολούθηση. Θα αποτελέσει έναν δυναμικό πόρο για την παγκόσμια επιστημονική κοινότητα, επιτρέποντας την εξερεύνηση των δυνατοτήτων των μικροοργανισμών.